Le batterie del Mini 3 Pro e del Mini 4 Pro non sono compatibili con il Mini 5 Pro. Le batterie del Mini 3 funzionano con il Mini 4 Pro, ma non viceversa, e il Mini 5 Pro utilizza le proprie batterie di volo intelligenti, che non sono compatibili con i modelli precedenti. Inoltre, l'utilizzo di batterie Mini 4 Pro nel Mini 5 Pro può aumentare il peso e far rientrare il drone in una classe di peso diversa (C1 invece di C0).