È la prima. Upstream significa che la porta USB è collegata "verso l'alto" nella gerarchia. In cima alla gerarchia c'è il dispositivo host (di solito un laptop o un PC) e in fondo ci sono le periferiche (chiavetta USB, mouse, tastiera ecc.).
L'upstream è quindi in direzione del dispositivo host e il downstream in direzione delle periferiche.
Puoi collegare tutti gli hub che vuoi (?) tra l'host e le periferiche, ecco perché viene fatta questa distinzione.
Ci sono anche nuove porte DRP (Dual Role Ports) per USB-C, che possono cambiare la loro funzione a seconda della situazione.